Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK1Q13546 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPK1Q13546 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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