Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCGQ13326 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCGQ13326 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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