Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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