Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
HMGXB3Q12766 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
HMGXB3Q12766 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC42.09■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
HMGXB3Q12766 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
HMGXB3Q12766 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
HMGXB3Q12766 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC42.06■■■■■ 4.32
HMGXB3Q12766 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
HMGXB3Q12766 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
HMGXB3Q12766 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms