Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pate4Q09098 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pate4Q09098 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pate4Q09098 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms