Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp2Q08652 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms