Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH1Q08174 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms