Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPARAQ07869 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPARAQ07869 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms