Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Col17a1Q07563 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Col17a1Q07563 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Col17a1Q07563 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Col17a1Q07563 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Col17a1Q07563 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms