Protein–RNA interactions for Protein: Q06330

RBPJ, Recombining binding protein suppressor of hairless, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPJQ06330 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBPJQ06330 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBPJQ06330 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBPJQ06330 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms