Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDSPL2Q05D32 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDSPL2Q05D32 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms