Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
CALD1Q05682 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CALD1Q05682 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CALD1Q05682 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms