Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARID5AQ03989 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID5AQ03989 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID5AQ03989 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms