Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha4Q03137 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms