Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkczQ02956 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkczQ02956 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkczQ02956 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkczQ02956 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkczQ02956 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkczQ02956 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms