Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROR1Q01973 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROR1Q01973 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.2 ms