Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE1BQ01064 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE1BQ01064 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.2 ms