Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms