Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Apba2P98084 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apba2P98084 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apba2P98084 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Apba2P98084 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apba2P98084 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apba2P98084 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apba2P98084 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apba2P98084 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Apba2P98084 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Apba2P98084 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apba2P98084 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apba2P98084 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apba2P98084 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apba2P98084 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apba2P98084 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apba2P98084 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Apba2P98084 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apba2P98084 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Apba2P98084 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apba2P98084 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apba2P98084 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms