Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbbp6P97868 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp6P97868 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbbp6P97868 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms