Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubg1P83887 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubg1P83887 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.4 ms