Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCNA1P78396 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNA1P78396 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNA1P78396 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms