Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHC1P78364 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHC1P78364 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHC1P78364 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHC1P78364 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHC1P78364 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHC1P78364 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHC1P78364 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHC1P78364 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHC1P78364 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHC1P78364 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHC1P78364 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHC1P78364 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHC1P78364 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHC1P78364 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHC1P78364 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHC1P78364 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHC1P78364 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHC1P78364 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHC1P78364 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHC1P78364 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHC1P78364 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHC1P78364 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHC1P78364 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHC1P78364 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHC1P78364 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHC1P78364 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHC1P78364 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHC1P78364 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHC1P78364 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHC1P78364 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHC1P78364 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHC1P78364 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHC1P78364 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHC1P78364 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHC1P78364 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHC1P78364 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHC1P78364 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHC1P78364 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHC1P78364 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHC1P78364 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHC1P78364 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHC1P78364 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHC1P78364 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHC1P78364 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHC1P78364 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHC1P78364 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHC1P78364 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHC1P78364 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHC1P78364 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHC1P78364 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHC1P78364 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHC1P78364 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHC1P78364 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHC1P78364 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHC1P78364 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHC1P78364 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHC1P78364 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHC1P78364 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHC1P78364 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHC1P78364 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHC1P78364 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHC1P78364 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHC1P78364 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHC1P78364 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHC1P78364 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHC1P78364 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHC1P78364 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHC1P78364 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHC1P78364 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHC1P78364 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHC1P78364 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHC1P78364 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHC1P78364 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHC1P78364 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHC1P78364 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHC1P78364 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHC1P78364 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHC1P78364 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHC1P78364 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHC1P78364 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHC1P78364 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHC1P78364 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHC1P78364 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHC1P78364 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHC1P78364 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHC1P78364 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHC1P78364 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms