Protein–RNA interactions for Protein: P70677

Casp3, Caspase-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp3P70677 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casp3P70677 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp3P70677 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp3P70677 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp3P70677 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp3P70677 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp3P70677 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp3P70677 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp3P70677 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp3P70677 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp3P70677 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp3P70677 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms