Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tp53bp1P70399 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tp53bp1P70399 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms