Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPD2P62316 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPD2P62316 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPD2P62316 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPD2P62316 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPD2P62316 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPD2P62316 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNRPD2P62316 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPD2P62316 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms