Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps11P62281 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps11P62281 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps11P62281 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps11P62281 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps11P62281 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps11P62281 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps11P62281 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps11P62281 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps11P62281 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps11P62281 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rps11P62281 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps11P62281 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204 ms