Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AP1S1P61966 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP1S1P61966 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms