Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2fP61219 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2fP61219 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2fP61219 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms