Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Romo1P60603 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Romo1P60603 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms