Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcif1P59114 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcif1P59114 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms