Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Exosc10P56960 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Exosc10P56960 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Exosc10P56960 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms