Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp1P55194 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1P55194 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 789.6 ms