Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMP3P54852 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EMP3P54852 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMP3P54852 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMP3P54852 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMP3P54852 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMP3P54852 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMP3P54852 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EMP3P54852 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMP3P54852 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EMP3P54852 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMP3P54852 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMP3P54852 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMP3P54852 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMP3P54852 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMP3P54852 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMP3P54852 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMP3P54852 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EMP3P54852 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EMP3P54852 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMP3P54852 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMP3P54852 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMP3P54852 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMP3P54852 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMP3P54852 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMP3P54852 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMP3P54852 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMP3P54852 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMP3P54852 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMP3P54852 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMP3P54852 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMP3P54852 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMP3P54852 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EMP3P54852 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMP3P54852 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMP3P54852 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMP3P54852 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMP3P54852 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EMP3P54852 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMP3P54852 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMP3P54852 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMP3P54852 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMP3P54852 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMP3P54852 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMP3P54852 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMP3P54852 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMP3P54852 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMP3P54852 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms