Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC24CP53992 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC24CP53992 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms