Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VEGFCP49767 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms