Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPAP49450 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPAP49450 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPAP49450 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPAP49450 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPAP49450 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPAP49450 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPAP49450 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPAP49450 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPAP49450 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPAP49450 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPAP49450 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPAP49450 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPAP49450 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPAP49450 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPAP49450 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPAP49450 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPAP49450 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPAP49450 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPAP49450 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPAP49450 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPAP49450 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPAP49450 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPAP49450 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPAP49450 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPAP49450 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPAP49450 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPAP49450 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPAP49450 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPAP49450 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPAP49450 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPAP49450 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPAP49450 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPAP49450 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPAP49450 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPAP49450 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPAP49450 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPAP49450 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPAP49450 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPAP49450 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPAP49450 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPAP49450 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPAP49450 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPAP49450 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPAP49450 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPAP49450 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPAP49450 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPAP49450 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPAP49450 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPAP49450 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPAP49450 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPAP49450 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPAP49450 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPAP49450 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPAP49450 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPAP49450 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPAP49450 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPAP49450 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPAP49450 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPAP49450 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPAP49450 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPAP49450 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPAP49450 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPAP49450 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPAP49450 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPAP49450 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPAP49450 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPAP49450 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPAP49450 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPAP49450 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPAP49450 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPAP49450 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPAP49450 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPAP49450 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPAP49450 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPAP49450 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms