Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atoh1P48985 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms