Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brca1P48754 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brca1P48754 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brca1P48754 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brca1P48754 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brca1P48754 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca1P48754 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca1P48754 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca1P48754 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brca1P48754 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brca1P48754 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.5 ms