Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
NESP48681 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NESP48681 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
NESP48681 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
NESP48681 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
NESP48681 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
NESP48681 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NESP48681 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
NESP48681 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NESP48681 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
NESP48681 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
NESP48681 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
NESP48681 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
NESP48681 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
NESP48681 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
NESP48681 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
NESP48681 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NESP48681 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NESP48681 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NESP48681 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NESP48681 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NESP48681 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NESP48681 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
NESP48681 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NESP48681 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NESP48681 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
NESP48681 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
NESP48681 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
NESP48681 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
NESP48681 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
NESP48681 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NESP48681 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NESP48681 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NESP48681 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
NESP48681 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
NESP48681 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
NESP48681 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
NESP48681 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
NESP48681 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NESP48681 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NESP48681 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NESP48681 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NESP48681 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NESP48681 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
NESP48681 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NESP48681 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
NESP48681 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
NESP48681 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
NESP48681 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
NESP48681 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
NESP48681 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
NESP48681 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NESP48681 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NESP48681 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NESP48681 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
NESP48681 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC41.32■■■■■ 4.2
NESP48681 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
NESP48681 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
NESP48681 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
NESP48681 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
NESP48681 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NESP48681 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
NESP48681 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NESP48681 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
NESP48681 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
NESP48681 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NESP48681 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
NESP48681 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NESP48681 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NESP48681 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NESP48681 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NESP48681 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NESP48681 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NESP48681 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NESP48681 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
NESP48681 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
NESP48681 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC41.26■■■■■ 4.2
NESP48681 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NESP48681 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
NESP48681 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NESP48681 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NESP48681 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
NESP48681 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NESP48681 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC41.26■■■■■ 4.19
NESP48681 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
NESP48681 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
NESP48681 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NESP48681 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
NESP48681 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
NESP48681 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NESP48681 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NESP48681 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NESP48681 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
NESP48681 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NESP48681 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NESP48681 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NESP48681 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NESP48681 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
NESP48681 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NESP48681 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms