Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf1P46099 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf1P46099 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klf1P46099 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klf1P46099 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klf1P46099 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klf1P46099 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf1P46099 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klf1P46099 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf1P46099 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf1P46099 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klf1P46099 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klf1P46099 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms