Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFRP42898 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTHFRP42898 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms