Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN2BP42772 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.8 ms