Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fen1P39749 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fen1P39749 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fen1P39749 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fen1P39749 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fen1P39749 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fen1P39749 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fen1P39749 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fen1P39749 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fen1P39749 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms