Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprkP35822 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprkP35822 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprkP35822 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PtprkP35822 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprkP35822 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PtprkP35822 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprkP35822 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprkP35822 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprkP35822 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprkP35822 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprkP35822 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PtprkP35822 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PtprkP35822 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PtprkP35822 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprkP35822 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprkP35822 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtprkP35822 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtprkP35822 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprkP35822 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprkP35822 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PtprkP35822 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PtprkP35822 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms