Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPA3P35244 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA3P35244 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA3P35244 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA3P35244 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA3P35244 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA3P35244 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA3P35244 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA3P35244 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA3P35244 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA3P35244 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPA3P35244 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA3P35244 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA3P35244 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA3P35244 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA3P35244 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA3P35244 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPA3P35244 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA3P35244 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA3P35244 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA3P35244 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA3P35244 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA3P35244 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA3P35244 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPA3P35244 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPA3P35244 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPA3P35244 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPA3P35244 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPA3P35244 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA3P35244 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA3P35244 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA3P35244 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA3P35244 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA3P35244 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA3P35244 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPA3P35244 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA3P35244 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA3P35244 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA3P35244 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA3P35244 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA3P35244 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA3P35244 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA3P35244 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA3P35244 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA3P35244 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPA3P35244 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA3P35244 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA3P35244 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA3P35244 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA3P35244 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA3P35244 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA3P35244 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA3P35244 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPA3P35244 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA3P35244 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA3P35244 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA3P35244 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA3P35244 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA3P35244 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA3P35244 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA3P35244 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA3P35244 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPA3P35244 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA3P35244 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA3P35244 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA3P35244 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA3P35244 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA3P35244 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA3P35244 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPA3P35244 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPA3P35244 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPA3P35244 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPA3P35244 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPA3P35244 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPA3P35244 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA3P35244 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA3P35244 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA3P35244 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA3P35244 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA3P35244 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA3P35244 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA3P35244 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA3P35244 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPA3P35244 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA3P35244 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA3P35244 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA3P35244 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA3P35244 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA3P35244 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA3P35244 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms