Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn11P35235 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn11P35235 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn11P35235 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn11P35235 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms