Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA6P31267 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms