Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msr1P30204 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msr1P30204 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msr1P30204 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Msr1P30204 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msr1P30204 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msr1P30204 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msr1P30204 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msr1P30204 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msr1P30204 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms