Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRDX6P30041 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms